twoside = semi vs. headwidth

twoside=semi bedeutet doppelseitiger Satz mit einseitigen Randbreiteneinstellungen und Marginalien. Insbesondere ist trotzdem der äußere Rand auf ungeraden Seiten rechts und auf geraden links. Der Offset wirkt immer in Richtung des äußeren Randes, ist aber bei textwithmarginpar gleich Null. Da die Linien in der Voreinstellung bündig mit dem Anfang des inneren Randes sind, entspricht das Verhalten der Kopfzeilenlinie in dem Beispiel der Dokumentation.

Aber, wenn es nur um die Benutzung von \leftmark und \rightmark in der Kopfzeile eines einseitigen Dokuments geht, braucht man twoside=semi gar nicht. Es genügt die Option autooneside=false für das Paket scrlayer-scrpage.

Das scheinbar seltsame Verhalten von \leftmark entsteht, weil als Gliederungsebene für die linke Marke section und für die rechte Marke chapter angegeben wurde - also genau anders herum als von Dir beabsichtigt. Entsprechend der Definition von \automark

\automark[Gliederungsebene der rechten Marke]{Gliederungsebene der linken Marke}

musst Du eigentlich

\automark[section]{chapter}

verwenden. Das entspricht auch der Voreinstellung, wenn man nur die Option automark setzt, d.h. die Angabe der Option genügt in diesem Fall.

Jetzt muss man nur noch verhindern, dass das Kapitel zwei Mal in der Kopfzeile auftaucht, wenn es noch keinen Abschnitt gibt.

Das Beispiel wird damit zu

\documentclass[headheight=27.2pt]{scrreprt}
 
\usepackage{scrlayer-scrpage}
\KOMAoptions{
   headtopline = 3pt,
   headwidth = textwithmarginpar,
   autooneside=false,
   automark
}
\clearpairofpagestyles
\ohead {
   \leftmark\\
   \ifstr{\leftmark}{\rightmark}{}{\rightmark}% <-sonst Leerzeichen
}
\pagestyle{scrheadings}
 
\usepackage{showframe}
\usepackage{lipsum}
 
\begin{document}
\chapter{Kapitel}
\section{Abschnitt}
\lipsum[1-20]
 
\listoftables
\chapter{nach LOT}
\lipsum[1-20]
\end{document}

Gruß
Elke

PS: Eine Erklärung, warum man sich mit manchen Mailadressen nicht anmelden kann, findest Du eventuell in diesem Thread.